Publikationen und Dokumente
2016
Kressing, F, Krischel, M: Development and Degeneration: Classification and Evolution of Human Populations and Languages in the History of Anthropology. In: Mendoza Straffon, L (Hrsg.): Cultural Phylogenetics. Concepts and Applications in Archaeology. Dordrecht, Berlin, Heidelberg, 19-41.
2015
Kressing, F: Lateral and Vertical Transfer in Biology, Linguistics and Anthropology: An Account of Widely Neglected Ideas in the Formation of Evolutionary Theory. Evolutionary Biology, online first, 24. Juni 2015, DOI 10.1007/s11692-015-9330-y.
2014
Kressing F, Krischel M: Netzwerke statt Stammbäume? - Lateraler Transfer in Evolutionstheorien von Sprachen, Arten und Kultur. In: Deutsche Gesellschaft für Geschichte und Theorie der Biologie (Hrsg.): Ordnung - Organisation - Organismus. Beiträge zur 20. Jahrestagung der DGGTB. Verhandlungen zur Geschichte und Theorie der Biologie, Band 18. Berlin: Verlag für Bildung und Wissenschaft (VWB), 1-14.
2013
Fangerau, H, Geisler, H, Halling, T, Martin, WF (Hrsg.): Classification and Evolution in Biology, Linguistics and the History of Science. Concepts - Methods - Visualization. Stuttgart: Steiner.
Fangerau, H, Kressing, F, Krischel, M: The "Global Phylogeny" and its Historical Legacy - A Critical Review of a Unified Theory of Human Biological and Linguistic Co-Evolution. Medicine Studies, Februar – online DOI 10.1007/s12376_013_0081-8.
Kressing, F: Mapping Human Biological and Linguistic Diversity - a Bridge between Sciences and Humanities. In: Fangerau, H, Geisler, H, Halling, T, Martin, WF (Hrsg.): Classification and Evolution in Biology, Linguistics and the History of Science. Concepts - Methods - Visualization. Stuttgart: Steiner, 97-108.
2012
Kressing, F: Screening indigenous peoples’ genes - the end of racism or postmodern bio-imperialism? In: Berthier S, Tolazzi S, Whittick S (Hrsg.) Biomapping Indigenous Peoples. Towards an Understandingof the Issues. Cross Cultures 151 – Readings in Post/Colonial Literatures and Cultures in English. Amsterdam, New York: Rodopi, 117–136.
List, J-M (2012a): Improving phonetic alignment by handling secondary sequence structures. In: Hinrichs, E. and Jäger, G. (eds.): Computational approaches to the study of dialectal and typological variation. Working papers submitted for the workshop organized as part of the ESSLLI 2012.
List, J-M (2012b): SCA: Phonetic alignment based on sound classes. In Slavkovik, M. & Lassiter, D. (eds.): New directions in logic, language, and computation. Springer, Berlin and Heidelberg. 32-51.
List, J-M (2012c): LexStat: Automatic detection of cognates in multilingual wordlists. In Proceedings of EACL, Joint Workshop of LINGVIS and UNCLH, April 23-24, Avignon, France. 117-125.
List, J-M (2012d): Multiple sequence alignment in historical linguistics. A sound class based approach. Proceedings of ConSOLE XIX (2011) 241-260.
Martin WF, Roettger M, Kloesges T, Thiergart T, Woehle C, Gould SB, Dagan T: Modern endosymbiotic theory: Getting lateral gene transfer into the equation. Endocytobiosis Cell Res 23:1-5.
Thiergart T, Landan G, Schenk M, Dagan T, Martin WF: An evolutionary network of genes present in the eukaryote common ancestor polls genomes on eukaryotic and mitochondrial origin. Genome Biol Evol 4:466-85.
2011
Dagan T: Phylogenomic networks. Trends Microbiol 19:483-91.
Fangerau, H, Kressing, F, Krischel, M: Netzwerke statt Stammbäume in der Wissenschaft? Die Entwicklung der evolutionären Theorie als wechselseitiger Transfer zwischen Geistes- und Naturwissenschaften. In: Krischel, M, Keul, H-K (Hrsg.), Deszendenztheorie und Darwinismus in den Wissenschaften vom Menschen. Stuttgart, 107–121.
Krischel, M, Keul, H-K (Hrsg.): Deszendenztheorie und Darwinismus in den Wissenschaften vom Menschen. Stuttgart.
Nelson-Sathi S, List JM, Geisler H, Fangerau H, Gray RD, Martin W, Dagan T: Networks uncover hidden lexical borrowing in Indo-European language evolution. Proc Biol Sci 278:1794-803.
Geisler, H List, J-M: Beautiful trees on unstable ground: Notes on the data problem in lexicostatistics. In: Hettrich, Heinrich (ed.): Die Ausbreitung des Indogermanischen. Thesen aus Sprachwissenschaft, Archäologie und Genetik, Akten der Arbeitstagung der Indogermanischen Gesellschaft Würzburg, 24.-26. September 2009. Wiesbaden: Reichert.
Kloesges T, Popa O, Martin W, Dagan T: Networks of gene sharing among 329 proteobacterial genomes reveal differences in lateral gene transfer frequency at different phylogenetic depths. Mol Biol Evol 28:1057-74.
Krischel, M; Kressing, F; Fangerau, H: Die Entwicklung der Deszendenztheorie in Biologie, Linguistik und Anthropologie als Austauschprozess zwischen Geistes- und Naturwissenschaften. In: H.-K. Keul, M. Krischel (Hrsg.), Deszendenztheorie und Darwinismus in den Wissenschaften vom Menschen. Steiner: Stuttgart, 107-121.
Martin W: Early evolution without a tree of life. Biol Direct 6:36.
Popa O, Hazkani-Covo E, Landan G, Martin W, Dagan T: Directed networks reveal genomic barriers and DNA repair bypasses to lateral gene transfer among prokaryotes. Genome Res 21:599-609.
Popa O, Dagan T: Trends and barriers to lateral gene transfer in prokaryotes. Curr Opin Microbiol 14:615-623.
Wagele H, Deusch O, Handeler K, Martin R, Schmitt V, Christa G, Pinzger B, Gould SB, Dagan T, Klussmann-Kolb A, Martin W: Transcriptomic evidence that longevity of acquired plastids in the photosynthetic slugs Elysia timida and Plackobranchus ocellatus does not entail lateral transfer of algal nuclear genes. Mol Biol Evol 28:699-706.
2010
Ahmadinejad N, Dagan T, Gruenheit N, Martin W, Gabaldon T: Evolution of spliceosomal introns following endosymbiotic gene transfer. BMC Evolutionary BMC Evol Biol 10:57.
Dagan T, Roettger M, Bryant D, Martin W: Genome Networks Root the Tree of Life between Prokaryotic Domains. Genome Biol Evol 2:379-392.
Fangerau H: Spinning the Scientific Web: Jacques Loeb (1859-1924) und sein Programm einer internationalen biomedizinischen Grundlagenforschung. Berlin.
Krischel M: "Perceived Hereditary Effect of World War I: A Study of the Positions of Friedrich von Bernhardi and Vernon Kellogg". Medicine Studies 2 (2), 139-150.
Krischel M: "Kritik an Charles Darwin und der Evolutionstheorie in der islamischen Welt".Uni Ulm intern - das Ulmer Universitätsmagazin, 302, 32-33.
Lane, N, Martin, W: The energetics of genome complexity. Nature, 467: 929-934. DOI: 10.1038/nature09486
List, J: Phonetic alignment based on sound classes. A new method for sequence comparison in historical linguistics. In: Slavkovik, Marija (Hrsg.): Proceedings of the 15th Student Session of the European Summer School for Logic, Language and Information. August 9-20, Copenhagen, Denmark. 192-202.
Martin W: Evolutionary origins of metabolic compartmentalization in eukaryotes. In: Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 365:847-55.
Wichmann, Søren; Holman, Eric W.; Müller, André; Velupillai, Viveka; List, Johann-Mattis; Belyaev, Oleg; Urban, Matthias & Bakker, Dik: Glottochronology as a heuristic for genealogical language relationships. Journal of Quantitative Linguistics 17.4. 303-316.
2009
Bapteste E, O'Malley MA, Beiko RG, Ereshefsky M, Gogarten JP, Franklin-Hall L, Lapointe FJ, Dupre J, Dagan T, Boucher Y, Martin W: Prokaryotic evolution and the tree of life are two different things Biol Direct. 4:34.
Dagan T, Martin W: Getting a better picture of microbial evolution en route to a network of genomes. Phil. Trans Roy. Soc. Lond. B 364: 2187–2196.
Fangerau H: From Mephistopheles to Iesajah: Jacques Loeb, Science and Modernism. Social Studies of Science 39:229-256.
Fangerau H, Halling T (Hrsg.): Netzwerke: Eine allgemeine Theorie oder die Anwendung einer Universalmetapher in den Wissenschaften. Bielefeld.
Krischel M, Kressing F, Fangerau H: Computergestützte Analyse in Biologie, Sprach- und Geschichtswissenschaft, in: Hegering H-G, Lehmann A, Ohlbach H-J, Scheideler C (Hrsg.) Informatik 2009 Im Focus das Leben. Beiträge der 38. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V., 582-594
Kressing F, Krischel M: Evolution in Biologie, Linguistik und Wissenschaftsgeschichte – Spannende Fragen zu Stammbaum-Modell und Sprachenvielfalt.
List, J: Sprachvariation im modernen Chinesischen. CHUN – Chinesisch-Unterricht. 123-140.
Roettger M, Martin W, Dagan T: A machine-learning approach reveals that alignment properties alone can accurately predict inference of lateral gene transfer from discordant phylogenies. Mol Biol Evol. 26:1931-9.
2008
Dagan T, Artzy-Randrup Y, Martin W: Modular networks and cumulative impact of lateral transfer in prokaryote genome evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105:10039–10044.
Geisler H: Konvergenz und Divergenzphänomene in der Romania: Lautentwicklung. In: Gerhard Ernst et al. (Hrsg.): HSK Romanische Sprachgeschichte. 3:255-265.