Projekt Sequenzanalyse

• Gute Programmierkenntnisse
• Interesse an Algorithmen und Datenstrukturen

• Minimalziel: Implementierung von Algorithmen zur Lösung diverser Probleme aus der Sequenzanalyse.
• Maximalziel: Die Implementierung soll effizienter sein als bekannte Software zur Lösung desselben Problems.
• Experimenteller Vergleich der eigenen Implementierung mit Software aus der Praxis.
• Dokumentation der Herangehensweise und der Ergebnisse in einem Praktikumsbericht.

Die Themen sollen - je nach Umfang - alleine oder in Gruppen bis zu drei Studierenden bearbeitet werden. Die Themen stammen aus dem Gebiet der Sequenzanalyse, insbesondere sollen Algorithmen auf Suffixarrays implementiert werden.

Eine Vorbesprechung mit der Vorstellung der Themen findet am 20.04.2010 um 14:30 Uhr im Raum O27/531 statt.