Kurzbeschreibung
Das Molekularmechanik-Programm NAMD bietet umfangreiche Möglichkeiten zur Berechnung chemischer und physikalischer Eigenschaften sehr großer molekularer Systeme. Aufgrund sehr schneller Kraftfeld-basierter Methoden können mit NAMD sehr große Systeme bestehnd aus mehreren tausend bis hin zu Millionen von Atomen simuliert werden. Viele statistischen und thermodynamischen Eigenschaften können aus den Simulationen abgeleitet werden. Im Gegensatz zu quantenchemischen Methoden steht jedoch die elektronische Wellenfunktion nicht zur Verfügung.
Kommunikations- und Informationszentrum (kiz)
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Self Service Funktionen des Identitätsmanagementsystems (IDM): Berechtigungen verwalten, Dienste abonnieren, Passwörter ändern etc.
Recherche im Bibliotheksbestand nach Monografien, Lehrbücher, Zeitschriften, Hochschulschriften, E-Books, E-Journals, Nationallizenzen, sowie im Bestand des institutionellen Repositoriums OPARU:
Etwa 400 Stichwörter führen Sie direkt zu einer einschlägigen Web-Seite des kiz. Wenn Sie ein Stichwort vermissen, geben Sie uns Nachricht an das Team Public Relations.
Verfügbarkeit an der Universität Ulm
Zielsystem/Zielgruppe | Verfügbarkeit |
Cluster und kiz Linux Pools (Ulm) | Siehe Versionsinformation; wenn für ein System keine Version angegeben ist, steht die Software auf dem System nicht zur Verfügung |
kiz Windows Pools (Ulm) | Nein |
Uni-Ulm-weiter Lizenzzugriff | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
Externer Lizenzzugriff | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
Softwarebezug Studierende | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
Softwarebezug Mitarbeiter | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen
Nachdem man eine kostenlose Lizenz auf der NAMD Webseite beantragt hat, kann man NAMD kostenlos für eigene Forschungsprojekte einsetzen.
Bitte zitieren Sie in Ihren Veröffentlichungen NAMD gemäß der Vorgaben, die Sie auf der NAMD Webseite finden.
Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug
Nach Registrierung können Sie NAMD im Bereich "DOWNLOAD" der NAMD Webseite herunterladen. Der Download enthält auch eine Installationsanleitung. Für Forschung und Lehre ist die Nutzung kostenlos.
Weiterführende Dokumentation
Im Bereich "DOCUMENTATION" der NAMD Webseite finden Sie eine ausführliche Dokumentation zu NAMD.
Zugriff auf Software
Nach dem Login auf einem der in der Versionsinfo genannten Cluster können sie dort mittels des Befehls
module load chem/namd
Zugriff auf die Default-Version des Programms NAMD erhalten. Alle verfügbaren NAMD-Versionen werden von dem Befehl
module avail chem/namd
angezeigt.
Support
Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.