Kurzbeschreibung
Das Molekularmechanik-Programm Gromacs bietet umfangreiche Möglichkeiten zur Berechnung chemischer und physikalischer Eigenschaften sehr großer molekularer Systeme. Aufgrund sehr schneller Kraftfeld-basierter Methoden können mit Gromacs sehr große Systeme bestehnd aus mehreren tausend bis hin zu Millionen von Atomen simuliert werden. Viele statistischen und thermodynamischen Eigenschaften können aus den Simulationen abgeleitet werden. Im Gegensatz zu quantenchemischen Methoden steht jedoch die elektronische Wellenfunktion nicht zur Verfügung.
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An den Service-Points können Sie uns persönlich aufsuchen.
Self Service Funktionen des Identitätsmanagementsystems (IDM): Berechtigungen verwalten, Dienste abonnieren, Passwörter ändern etc.
Recherche im Bibliotheksbestand nach Monografien, Lehrbücher, Zeitschriften, Hochschulschriften, E-Books, E-Journals, Nationallizenzen, sowie im Bestand des institutionellen Repositoriums OPARU:
Etwa 400 Stichwörter führen Sie direkt zu einer einschlägigen Web-Seite des kiz. Wenn Sie ein Stichwort vermissen, geben Sie uns Nachricht an das Team Public Relations.
Verfügbarkeit an der Universität Ulm
| Zielsystem/Zielgruppe | Verfügbarkeit |
| bwUniCluster (Karlsruhe) | Ja, nach Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| bwForCluster JUSTUS (Ulm) | Ja, nach Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| kiz CUSS Linux Cluster (Ulm) | Nein |
| kiz Linux Pools (Ulm) | Nein |
| kiz Windows Pools (Ulm) | Nein |
| Uni-Ulm-weiter Lizenzzugriff | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
| Externer Lizenzzugriff | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
| Softwarebezug Studierende | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
| Softwarebezug Mitarbeiter | Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden |
Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen
Das Programm Gromacs steht under der General Public License (GPL) und kann daher von jedem kostenlos verwendet werden.
Bitte zitieren Sie in Ihren Veröffentlichungen Gromacs gemäß der Vorgabe, die Sie auf der Gromacs Webseite finden.
Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug
Sie können Gromacs kostenlos im Bereich "Download" der Gromacs Webseite herunterladen. Dort finden Sie auch eine Installationsanleitung.
Weiterführende Dokumentation
Im Bereich "Documentation" der Gromacs Webseite finden Sie eine ausführliche Dokumentation zu Gromacs.
Zugriff auf Software
Nach dem Login auf einem der oben genannten Cluster können Sie dort mittels des Befehls
module load chem/gromcas
Zugriff auf die Default-Version des Programms Gromacs erhalten. Alle verfügbaren Gromacs-Versionen werden von dem Befehl
module avail chem/gromacs
angezeigt. Detaillierte Hilfe und Beispiele für das Queueing-System erhalten Sie mittels des Befehls
module help chem/gromacs
Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie Gromacs verwenden.
Support
Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.